中科院海洋所对虾研究取得重大突破

获高质量基因组参考图谱

　　中工网讯（记者杨明清）中科院海洋所对对虾的研究近日取得重大突破。该课题研究组与国内外多家单位合作,历时10年成功破译了凡纳滨对虾基因组,获得了世界上首个高质量的对虾基因组参考图谱。

　　凡纳滨对虾也叫南美白对虾,是市场上最常见的一种对虾，凡纳滨对虾在海水、淡水中都能养殖,具有重要的物种价值,我国凡纳滨对虾的虾苗繁育多在海南进行,但种源却依赖从南美进口。从2009年开始,中科院海洋所相建海和李富花研究组着手攻关研究对虾分子遗传育种工作,以繁育的新品种“科海一号”雄虾为样本,致力于破译凡纳滨对虾基因组。

　　据了解，对虾基因组是世界上公认的高复杂基因组,阻碍了多个国际科研机构的研究步伐。1996年,全球学术界启动了大马哈鱼、罗非鱼、鲶鱼、牡蛎、对虾这5种水产动物基因组测序工程。随着科技的进步,其他4种水产动物的基因组测序先后完成,只有对虾的基因组由于量大且复杂没能破译。

　　据介绍,别看对虾的个头不大,但其基因组大小与人类的基因组相比,能占到人类的三分之二,并且基因组中有许多重复且出现频率高的基因片段。“就好像拼图一样,有大量极为类似的拼图碎片,想要对其正确排序、组合十分困难。”该所相关人士称,前后10年的时间里,他们尝试了从一代到三代的各种测序平台以及各种组装软件,最终完成了凡纳滨对虾的全基因组的测序和组装,并获得高质量的参考图谱。